冷阱是一種阻止蒸氣或液體從系統進入測量儀器，或從測量儀器進入系統的一種裝置。理論上講，冷阱溫度越低，冷阱的捕水能力越強，但冷阱溫度低，對制冷要求高，機器成本及運轉費用高。實驗室冷凍干燥機的冷阱溫度主要有-50℃左右、-60℃左右、-80℃左右等幾個檔次。
冷阱蒸發的速率不僅受到攝入能量的影響，而且受到真空泵的泵速影響。較大的樣品蒸發表面積是影響真空泵效率的瓶頸所在，而不是樣品容量和數量。更為有效的是使用冷阱，而不是用更大的真空泵。由于冷阱的使用，一方面有利于水蒸氣凝結，另一方面提高了有機溶劑蒸發密度，更易于凝結。
冷阱溫度為-50℃的凍干適用于一些容易凍干的產品；
冷阱溫度為-60℃左右的凍干機適用于大部分產品的凍干；
冷阱溫度為-80℃的凍干適用于一些特殊產品的凍干。
冷阱溫度對捕水能力的影響實驗表明冷阱溫度從-35℃下降到-55℃，捕水能力有提升明顯，冷阱溫度低于-55℃，冷阱的捕水能力提升不明顯。因此在沒有特殊需求的情況下，選用冷阱溫度-60℃左右是理想的選擇。
